產(chǎn)品詳細介紹：
Pippin Prep全自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)
手工切膠DNA回收一直是一項繁瑣且不精確的技術。隨著高通量測序的廣泛應用，希望DNA片段大小回收能夠自動化完成的業(yè)界需求越來越強烈。
Sage Science公司由此開發(fā)出了 Pippin Prep 全自動核酸電泳片段回收儀，高質量地完成包括建庫在內的多種實驗過程中分離純化各種大小 DNA 片段的需求。
產(chǎn)品特點：
> 軟件設置片段大小范圍，儀器準確完成分離純化
> 回收DNA片段直接應用于高通量測序文庫構建
> 每一輪只需3-6 分鐘手工操作
> 一次性預制膠槽，杜絕交叉污染
全自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)技術原理：
實驗運行中，軟件通過實時光路檢測并比對DNA ladder，確定要回收的DNA片段到達洗脫泳道(elution channel)的準確時間。通過電極切換，打開洗脫泳道，使目標片段進入洗脫通道的回收室中，從而實現(xiàn)回收。
操作流程：
> 一站式操作，簡易直接
> 3-6分鐘的手工時間
> 無復雜前處理過程
>回收的樣本可直接進行PCR擴增，參與下一步實驗。
應用范圍：
核酸片段的自動化回收可用于生命科學的多個方面。對于前沿熱點之一的高通量測序（next-generation sequence），Pippin Prep為其文庫制備過程中所需的核酸片段回收給出了詳細解決方案。
產(chǎn)品覆蓋范圍: 50 – 10，000bp.
PE Libraries（配對末端文庫）
> 1.5% (300-1500bp)
> 2% (100-600bp)
> 2% 不含EB (100-600bp)
miRNA Libraries（小RNA文庫）
> 3% (50-300bp)
Mate-pair Libraries（大片段兩端序列文庫）
> 0.75% (1-10kb)
ChIP-seq（染色質免疫沉淀-深度測序）
> 1.5% and 2% (sealed elution modules設計, 可用于長時間洗脫)
性能*：
Ø 2%預制膠用于PE文庫構建
Pippin Prep基本上避免了小分子量核酸片段的污染，且有更高的回收效率，提升了PE文庫構建質量。
> 1.5%預制膠用于PE文庫構建
1.5%和2%預制膠均可用于PE文庫構建，根據(jù)實際應用的高通量測序平臺對回收片段大小的要求來從二者之中進行選擇。
Ø 3% 預制膠用于miRNA文庫構建
3%預制膠能有效的將miRNA 文庫和接頭二聚體(adapter dimers)以及大分子量的RNA片段區(qū)分開并且分離純化出來。
Ø 1.5%預制膠用于ChIP-seq文庫構建
ChIP應用一般要求較寬范圍(broad type)的片段大小回收。Pippin Prep能夠滿足實驗需求。
微量基因組DNA樣品中核酸片段的回收
Pippin Prep核酸電泳和片段回收系統(tǒng)，和Agilent生物分析儀的高靈敏度芯片聯(lián)用，可以預先分析微量基因組DNA中的片段長度范圍分布，供用戶選擇合適的核酸片段的回收長度范圍。同時Agilent生物分析儀，也是評估微量微量核酸片段回收產(chǎn)物的一個理想選擇。
在Agilent生物分析儀上分析Pippin Prep的回收產(chǎn)物。用2% 瓊脂糖凝膠電泳來回收中心位于150bp的緊密分布的核酸片段 (Pippin Prep settings: bptarget = 150). 插圖所示為產(chǎn)物峰值區(qū)域的放大。
因為Agilent生物分析儀的高靈敏度芯片只需ng級的DNA的上樣量，所以它是一個理想的工具，和Pippin Prep自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)聯(lián)用，來分析樣品中核酸片段的長度分布。知道了樣品中核酸片段的長度分布，用戶就可以在Pippin Prep系統(tǒng)上選擇合適的核酸片段長度范圍，因此，能夠增強用戶對核酸片段長度的選擇控制，從而大大地提高文庫構建的成功幾率。
Agilent生物分析儀的高靈敏芯片也是評估Pippin Prep回收產(chǎn)物的一個非常好的選擇，它有足夠的靈敏度來評估基因組DNA中的很窄的長度范圍的片段回收產(chǎn)物。上樣量低達50ng。
通過調整核酸片段的回收長度范圍來提高回收產(chǎn)量
Pippin Prep自動化核酸片段選擇和回收系統(tǒng)被設計用于非常窄的片段分布的gDNA樣品制備。因此，默認的“緊密型”片段回收設置得到的產(chǎn)物的片段長度分布明顯地比傳統(tǒng)方法窄。如果“緊密型”片段回收設置有時不能夠得到足夠的回收量，用于構建文庫。用于可以通過擴大片段長度的選擇范圍來大大地提高回收產(chǎn)量。
把片段長度范圍從80 bp擴大到150 bp，回收產(chǎn)量提高3-5倍。這些數(shù)據(jù)表明，如果“緊密型”片段回收設置不能得到足夠量的產(chǎn)物。用戶可以通過擴大核酸片段長度的回收范圍，來大大地提高回收產(chǎn)物量。
